Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms