Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms