Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms