Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms