Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA3P32297 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms