Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms