Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms