Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAP3P28838 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAP3P28838 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAP3P28838 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms