Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPREP23469 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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