Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB1P23443 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms