Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFE3P19532 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFE3P19532 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms