Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2CP19387 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2CP19387 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms