Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms