Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME1P15531 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME1P15531 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME1P15531 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms