Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2F2P13984 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2F2P13984 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms