Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD1P0DJD0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms