Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3P08700 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3P08700 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3P08700 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3P08700 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3P08700 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IL3P08700 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IL3P08700 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IL3P08700 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3P08700 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3P08700 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3P08700 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms