Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA5P08648 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms