Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms