Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNC1O60486 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNC1O60486 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms