Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NDUFS5O43920 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms