Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP9BO43861 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP9BO43861 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms