Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENRO43583 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENRO43583 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms