Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXO3O43524 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXO3O43524 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms