Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM6AO15550 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms