Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TO15178 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TO15178 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TO15178 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TO15178 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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