Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms