Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PATL2C9JE40 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms