Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DGG1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DGG1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DGG1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
B4DGG1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
B4DGG1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DGG1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms