Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms