Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
V9GYY9 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
V9GYY9 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
V9GYY9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms