Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms