Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEF1Q9Y4P9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms