Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms