Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPS28Q9Y2Q9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms