Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms