Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms