Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG4Q9ULP0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms