Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FBXL4Q9UKA2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms