Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms