Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms