Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP2BPQ9P2M1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms