Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms