Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms