Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ABCC13Q9NSE7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms