Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF275Q9NSD4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms