Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms