Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms