Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDHB16Q9NRJ7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDHB16Q9NRJ7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms