Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CARS2-226ENST00000541443 574 ntTSL 58.04□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-217ENST00000541652 753 ntTSL 28.02□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MIR100HG-204ENST00000528381 554 ntTSL 58□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAD54L2-202ENST00000432863 3926 ntTSL 27.99□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-210ENST00000630041 602 ntTSL 57.98□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN5-206ENST00000451455 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.98□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN5-204ENST00000436386 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.98□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-226ENST00000552449 277 ntTSL 37.97□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-226ENST00000434781 565 ntTSL 57.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-303ENST00000626842 741 ntTSL 57.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SKAP2-202ENST00000432747 577 ntTSL 47.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PTK2-249ENST00000523679 504 ntTSL 37.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-214ENST00000524124 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-214ENST00000456515 872 ntTSL 37.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GTF2E2-203ENST00000518599 737 ntTSL 57.94□□□□□ -1.144e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.149e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SDHB-202ENST00000463045 702 ntTSL 37.92□□□□□ -1.149e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRR11-204ENST00000578777 860 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FHIT-203ENST00000466788 3063 ntTSL 47.9□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NETO2-204ENST00000563078 581 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RPL9-202ENST00000437992 579 ntTSL 47.86□□□□□ -1.154e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 57.86□□□□□ -1.159e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC66-211ENST00000468108 567 ntTSL 47.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-223ENST00000551872 571 ntTSL 27.83□□□□□ -1.168e-16■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 APOO-209ENST00000634188 713 ntTSL 47.82□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LANCL2-205ENST00000486376 689 ntTSL 57.82□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.169e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-369ENST00000631107 840 ntTSL 57.8□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-207ENST00000415222 502 ntTSL 47.75□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CNOT10-208ENST00000463006 692 ntTSL 37.73□□□□□ -1.179e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS5-213ENST00000427213 616 ntTSL 37.73□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS5-211ENST00000534288 591 ntTSL 47.71□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AFG1L-202ENST00000421954 1741 ntTSL 57.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-211ENST00000460724 570 ntTSL 37.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP42-202ENST00000524649 489 ntTSL 37.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GMPR-204ENST00000544145 750 ntTSL 37.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 37.59□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATXN10-210ENST00000493643 617 ntTSL 57.58□□□□□ -1.29e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC005537.1-210ENST00000631088 437 ntTSL 57.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 YY1-205ENST00000554804 1114 ntTSL 37.58□□□□□ -1.29e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.29e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NETO2-205ENST00000564667 799 ntTSL 47.57□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 COMMD1-205ENST00000455659 388 ntTSL 37.57□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TPD52-210ENST00000519250 585 ntTSL 47.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRKDC-209ENST00000540819 537 ntTSL 37.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATG7-210ENST00000435760 647 ntTSL 47.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CKLF-CMTM1-203ENST00000529718 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.51□□□□□ -1.219e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATG7-204ENST00000418682 584 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMLHE-206ENST00000487422 544 ntTSL 27.5□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-213ENST00000548713 551 ntTSL 47.5□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-204ENST00000413436 602 ntTSL 47.49□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LRAT-202ENST00000499392 603 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IWS1-211ENST00000497888 592 ntTSL 27.47□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-205ENST00000529068 529 ntTSL 47.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 QARS-250ENST00000637281 1327 ntTSL 57.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAB31-202ENST00000577284 604 ntTSL 47.44□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-209ENST00000585122 705 ntTSL 57.4□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PDE11A-205ENST00000433879 1310 ntTSL 57.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATG7-211ENST00000444619 565 ntTSL 47.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CEP63-207ENST00000508778 464 ntTSL 37.38□□□□□ -1.239e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-201ENST00000366234 884 ntTSL 57.37□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RPL9-208ENST00000508595 667 ntTSL 37.36□□□□□ -1.234e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 POP4-204ENST00000586173 629 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPPL2A-203ENST00000558414 564 ntTSL 47.34□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-205ENST00000502983 609 ntTSL 37.33□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPY19L4-207ENST00000522669 548 ntTSL 47.33□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS5-203ENST00000428971 580 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KNL1-210ENST00000532406 579 ntTSL 37.3□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1358.5 ms